学生基层党组织建设未得到应有的重视；另一方面，学生基层党组织自身对思想理论建设不重视，对入党积极分子为共产主义理想奋斗、全心全意为人民服务的基本入党动机教育不够，对学生党员的思想教育和管理抓得不严等。从现状分析，高校学生基层党组织建设中问题的成因主要有三个方面：一是片面理解党和国家对大学生思想政治教育、大学生党员发展工作的指示，重发展轻教育。二是社会诸多变革以及党内外各种不正之风对高校学生基层党组织建设的影响。三是高校各级党组织对学生基层党组织自身建设重视不够。
四、解决高校学生基层党组织建设中存在问题的对策
1.完善高校学生党建工作的组织结构体系，齐抓共管，统一协调
加强学生基层党支部建设必须设立专门负责学生党建工作的协调机构，组织部、学工部、党校、各院系党委（总支）齐抓共管，多方联手，加强沟通和协调，更好地统筹高校学生党建工作的开展。
2.抓教育考察，构建入党培训的有效机制
由于高校培养的大学生党员都是未来社会主义建设的中坚力量，是我国干部队伍的后备军，这就要求高校党务工作者在发展大学生党员时要深入到学生中去了解他们的思想动态，宣传党的知识，用马列主义、毛泽东思想和“三个代表”重要思想以及科学发展观帮助积极分子坚定信念，树立正确的世界观、人生观和价值观。要在早期培养和发展工作中加大力度，开展一系列制度化的工作。首先是建立入党积极分子教育培训制度。从新生入学开始就进行“知党、爱党、跟党走”的教育，把党的基本知识融入入学教育中，激发学生的入党热情。其次是建立入党积极分子定期考察制度。规范组织程序是保证党员质量的关键性环节，对入党积极分子的培养要制订培养计划，定期进行考察培养，成熟一个发展一个。再次是建立学生党员参与入党积极分子教育、培养工作机制，学生党员与入党积极分子结对子，互帮互助，充分发挥学生党员的作用。最后是坚持“三会一课”和党内民主生活制度，针对重发展轻入党后的教育培养问题，基层党组织要开展丰富多彩、卓有成效的党组织活动，不断提高学生党员的政治思想觉悟，增强党性，使其不仅在组织上入党，要真正从思想上入党。入党后的教育培养是高校基层党组织建设中的关键环节之一，具有十分重要的战略意义。
3.创新基层学生党组织的工作模式
基层党组织的工作只有通过渗透到各个层面才能充分体现其先进性，不断提升影响力。党的工作要进共青团组织、进学生会、进公寓，在各种学生团队组织中强化学生党组织的核心地位，努力将团支部、学生会、学生团体等组织建设成为大学生工作、学习和生活的核心，培育优秀的团队精神，搭建思想政治教育的新平台。
4.建立健全对学生党员的考核机制
为提高学生党员考核管理工作的规范性和科学性，可对学生党员实行量化考核与管理。每一项考核指标都有分值，各支部对所在支部学生党员进行打分并进行公布，以此作为考评的重要依据。通过量化考核可提高学生党员们的身份意识和责任意识，纯化净化党员队伍。
5.建立完善实践锻炼机制
通过多种途径发挥学生党员先锋模范作用，建立党员责任区、学生党员带头参加志愿者活动等，在校内各种实践中锻炼学生党员的思想觉悟，体现党员的先进性，充分发挥党员的先锋模范作用。
6.优化人员配置，增强学生基层党组织的力量
优化大学生基层党建工作人员配置，第一要本着德才兼备与专兼结合的原则，按照政治强、业务精、作风正的要求，着力打造一支以专职党建干部为基础、兼职党建干部为补充的专业搭配和配置合理的党建工作队伍。第二要对大学生基层党务工作者定期进行党建理论的教育培训，提高他们的综合素质，使之成为既懂党建工作又懂业务技术知识的新型党务工作者
