“科学家精力的大部分，用在了申请项目、请客吃饭、拉关系上，用于科研的时间、精力和经费都少之又少。”
“科技部实际上已演化成一个控制大量科技经费的部门”。这是饶毅、邹承鲁、鲁白三位科学家对科技部功能最为严厉的指责。
百亿大财东的行政力量
据科技部、国家统计局等部门的资料显示，中国每年大约有1000亿元左右的科技经费投入，其中约150亿由科技部来支配。
科技部支配的科技资金项目大致可分为：科技攻关计划、高技术研究发展计划(863计划，始于1986年3月——当时为了跟上和发展世界先进科学技术，中共中央、国务院批准了《高技术研究发展计划(863计划)纲要》)；国家重点基础研究发展规划(973计划，根据1997年6月4日原国家科技领导小组第三次会议《国家重点基础研究发展规划》具体设立)；星火计划(面向农业)；火炬计划(面向高新技术产业化)；科技成果重点推广计划；国家重点新产品计划；科技兴贸行动计划；科技型中小企业技术创新基金；农业成果转化基金等。
科技经费中的大项目，一般指国家科技计划项目，即由科技部归口管理的面向研究开发的国家三大主体科技计划的项目和课题：863计划、科技攻关计划和基础研究计划(973)项目。
在科技经费的分配即科技计划的申请、批准诸环节中，官员的“行政干预”最为科学家所诟病。官员的个人偏好，有时决定了科技经费的流向。
科技部一位学者对《中国新闻周刊》坦言，大项目决策，往往“并不是专家说了算，官员起了很大的作用。领导说要做什么事，马上就可以花很多钱去做事情。”
高层官员的偏好也许决定了资金的最初走向。这是利益链条中最上面的一环。
而一层层的官员都有自己的偏好，这一切所形成的合力决定了资金走向的最终结果。善于跟官员打交道的人就可以得到资金，不善于公关的可能就得不到。“这就增加了获得课题的成本”，这位人士说。
中科院院士郝伯林是1977年全国自然科学长远规划中物理学规划总纲的起草人。他经过数次参与规划之后认为，“搞规划的专家，任务就是写出文字材料交差，但规划与实际政策的制定和经费划拨没有多少关系。”此后，郝伯林愤而退出这类邀请，再也不去“装模作样”了。
邹承鲁从1980年代初期，开始在报上撰文批评科学管理体制的一些问题。开始的时候，“部里有会还找(我)，后来就慢慢不找了。”
邹承鲁的解释是，“他们现在请的，都是自己的人。官员会说些诱导性的话，专家为了跟官员搞好关系，也说附庸的话，结果总是能符合领导意图。你如果说了相反的意见，你就被边缘化了。”
官员与专家的合力
周成虎，863“十五”第二届“信息获取与处理技术”主题专家组副组长，上届海洋组主题专家，“资源与环境信息系统国家重点实验室”主任。
周成虎对《中国新闻周刊》称，“非常大的项目在上面就申报完了，到不了我们这里。”
周所称的“到不了我们这里”，是指863重大专项的决策，到不了主题专家参与决策的层面。863计划分为两种：一种是重大专项项目，一种是主题项目。863的专家组，也分为领域专家和主题专家两种。
863计划重大专项以重大产品、系统或工程为核心，以国家重大战略需求、市场和应用为导向，突出国家目标，其管理工作主要包括组建专项总体专家组、专项可行性报告论证、编制专项课题标书和指南、专项课题评审立项和专项执行等五个方面。
重大专项决策，一般由“专项总体专家组”和科技部高层共同商定，经过专项可行性论证和审评立项，就能确定下来。其过程比主题项目要简单。这也就是在一些科学家口中流传的“大钱不评、中钱小评、小钱大评”中所谓“不评”的项目。其中的关键，是“专项总体专家组”人员名单的确定。
这类重大专项评审简化的另一个弊端，是官员的偏好之外，也为个别专家的偏好打开了方便之门。中科院一位科学家对《中国新闻周刊》称，重大项目由于极高的封闭性，个别专家虽然自己回避项目申请，但其学生、亲友、弟子，以及某些行政官员的亲友，带着各类相关不相关的课题，只要跟重大项目沾点边，就都可以划到这个圈子里来。
此类专家和官员，成为利益链条中的第二个环节。
这位科学家向《中国新闻周刊》透露，一项总额达2500万的重大专项项目，分6个课题，分别由十几个单位承担。其中，一项课题分配在他们所，所里又下划到4个下属单位。到所里的资金大致是500万。500万经交税和所里提成8%之后，剩下450万左右。这450万又要分给4个单位。分到他这个小单位的，就只有120万块钱左右。这120万，又要分给“上册”人员和“不上册”的人员，其中上册的有8个，不上册的有12个。结果，每人得到的科技经费，是1??8万元～10万元左右。
这种撒胡椒面式的资金分配，丧失了重大项目的根本意义。“真正干活的，拿到的反而不多，这又有什么意义呢？”这位科学家反问。
“项目出来了对大家都有好处”
重大项目如此，那么主题项目呢？仍以863为例，其中玄妙，几可与大项目比肩。
863的主题项目，以鼓励原始性创新、攻克关键技术、掌握自主知识产权为导向，其管理工作主要包括课题指南的编制与发布、课题评审、课题立项、课题经费预算和课题执行等五个方面。
一位曾经任过中科院某所科技处处长的科学家温澜(化名)，向《中国新闻周刊》介绍了评审立项的“潜规则”。
首先是按照指南写项目申请书。申请书的质量当然首先要差不多。其次，找到科技部863办公室的某个处。当然，某处与长期从事科研经费申请的温澜关系不错。然后由该处请5位“牢靠”的主题专家，甚至可以由申请人本人亲自在20人左右的主题专家组中挑选。
“在那么多的专家中，挑选几个跟自己关系好、又有往来的专家，事情就十拿九稳了。”温澜说。
主题专家组的评审，分为“优良中差”等几个等级。要想通过审评，一般来说就得保证每个专家的打分，不能低于“良”，最好是全“优”。因此，所请的5个专家，每一个都很重要。
主题专家组评审结果出来以后，评分并不当场公布。科技部主管部门的官员将评审结果取走，再交给领域专家审议。如果前者评审已经过关，领域专家一般不再会有异议。
可见，主题项目评审的关键人物，就是主题专家和某些部门官员。要搞好关系的核心也是他们。
经过立项和经费逐年划拨之后，一般3年的项目，到两年半的时间，会通知成果检验。
验收的专家和当初批准立项的专家，基本上是同一拨人。验收程序如下：
先由项目负责人作汇报，然后专家组开始讨论。专家一般在10个左右，讨论总体评价，由评审组起草，或由项目承担人起草，达到什么水平，比如“项目达到国内领先水平”，措辞要逐句地琢磨，专家会说一两句哪些方面略显不足的话，但基调已定。
请专家验收之前，项目负责人一般已经与专家打过招呼——提问题不要太具体，尖锐的问题不会提。专家如果提了尖锐问题，下次也许不会再请这个人。鉴定结果由评审组组长交给项目承担方。
“科学界(的名声)不是你自己吹出来的，是互相吹出来的，在哪儿都不可避免。项目出不来，就意味着在这个主题上面大家都出不来，而出来了对大家都有好处。”温澜自己作为评审专家，也参加过类似的验收会，所以深有感触。
在利益链条中的最末端，就是个别小专家和温澜这样的受益者。
当然，按照温澜的说法，那些跟科技部有关部门和个别专家“关系不好”、只知道攻技术的倒霉蛋儿，就比较麻烦了。即便你申请的技术比别人强一点，也只能等着。温澜去年帮同行申请的一个项目，自觉技术水平还可以，但只能干等着。
项目申请下来之后的一个关键环节，是经费的使用。除了所里常规的以管理费的名义截留5%～8%之外，项目经费“真正用于搞研究的钱，占的比例反而不大，能有一半就不错了。”这主要是因为上个世纪80年代末的科研经费改革，使得科研人员没有了基本的事业费，工资支出等生活费用也要从项目经费中得到的缘故。
也因为此，争取项目便成为一条激烈的竞争通道。即便863和973最后流到个体科研工作者那里的钱再少，科学家也要争取。
“科学家精力的大部分，用在了申请项目、请客吃饭、拉关系上，用于科研的时间、精力和经费都少之又少。”温澜直陈，这种情况已不再是个别现象。
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